农村拆迁应当向房屋征收部门主张补偿。市、县级的房屋征收部门负责本行政区域的房屋征收与补偿工作，房屋征收部门可以委托拆迁公司作为房屋征收实施单位承担具体工作。
一、拆迁补偿协议的主体都有哪几个
由于被拆迁房屋分为私有房屋和公有房屋，所以当拆迁对象为私有房屋时，拆迁人应当与房屋所有人签订拆迁补偿安置协议，而当拆迁对象为公有房屋时，拆迁人则应当与房屋使用人订立拆迁补偿安置协议。此外，当房屋拆迁的对象为租赁房屋时，所涉人员范围较复杂，拆迁人应当与房屋所有权人和房屋承租人共同订立拆迁补偿安置协议。据我国现行法律规定，房屋征收部门应当是事先由市、县级确定的负责组织实施本行政区域的房屋征收与补偿工作的部门。
二、土地征收时自建房被强拆如何处理
土地征收时自建房被强拆的可以向征地单位的上级投诉。
《国有土地上房屋征收与补偿条例》
第四条市、县级负责本行政区域的房屋征收与补偿工作。
市、县级确定的房屋征收部门（以下称房屋征收部门）组织实施本行政区域的房屋征收与补偿工作。
市、县级有关部门应当依照本条例的规定和本级规定的职责分工，互相配合，保障房屋征收与补偿工作的顺利进行。
第五条房屋征收部门可以委托房屋征收实施单位，承担房屋征收与补偿的具体工作。房屋征收实施单位不得以营利为目的。
房屋征收部门对房屋征收实施单位在委托范围内实施的房屋征收与补偿行为负责监督，并对其行为后果承担法律责任。
第六条上级应当加强对下级房屋征收与补偿工作的监督。
住房城乡建设主管部门和省、自治区、直辖市住房城乡建设主管部门应当会同同级财政、国土资源、发展改革等有关部门，加强对房屋征收与补偿实施工作的指导。
第七条
任何组织和个人对违反本条例规定的行为，都有权向有关、房屋征收部门和其他有关部门举报。接到举报的有关、房屋征收部门和其他有关部门对举报应当及时核实、处理。
监察机关应当加强对参与房屋征收与补偿工作的和有关部门或者单位及其工作人员的监察。
三、公司能否自己作为强拆的主体吗
在一定条件下可以。根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第五条规定：房屋征收部门可以委托房屋征收实施单位，承担房屋征收与补偿的具体工作。房屋征收实施单位不得以营利为目的。房屋征收部门对房屋征收实施单位在委托范围内实施的房屋征收与补偿行为负责监督，并对其行为后果承担法律责任。