公司申请破产后债务由公司的所有财产来清偿，根据法律规定，公司是企业法人，有的法人财产，享有法人财产权，公司以其全部财产对公司的债务承担责任。有限责任公司的股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任;股份有限公司的股东以其认购的股份为限对公司承担责任。
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